Erziehungsmaßnahmen sind in sehr vielen Fällen noch wichtiger als der Unterricht, weil sie erst einen geordneten Unterricht ermöglichen.

Die Schulordnung, die mit der Johannesschule gemeinsam erstellt worden ist, regelt das Zusammenleben aller an der Schule beteiligten Personen. Außerdem schützt sie das Eigentum, das anderen oder allen gehört. Wichtig für das Funktionieren der Schulordnung ist die allseitige Akzeptanz. Deswegen muss der Sinn der Ordnung Kindern und Eltern immer wieder begreiflich gemacht werden. Damit man glaubwürdig ist, müssen Verstöße gegen die Regeln geahndet werden, wobei auch wichtig ist, dass Sanktionen sofort folgen und nicht berechenbar werden.